Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cass4Q08EC4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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