Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MestQ07646 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms