Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cdx4Q07424 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cdx4Q07424 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms