Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Siah2Q06986 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms