Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Prrx2Q06348 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Prrx2Q06348 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms