Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cab39Q06138 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cab39Q06138 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms