Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Thbs3Q05895 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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