Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sox12Q04890 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm42619-201ENSMUST00000197564 1136 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sox12Q04890 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms