Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Top1Q04750 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1Q04750 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Top1Q04750 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms