Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Msx2Q03358 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms