Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cacna1sQ02789 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cacna1sQ02789 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms