Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjb4Q02738 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms