Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GscQ02591 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GscQ02591 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GscQ02591 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GscQ02591 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms