Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RykQ01887 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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RykQ01887 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RykQ01887 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RykQ01887 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RykQ01887 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RykQ01887 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
RykQ01887 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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RykQ01887 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
RykQ01887 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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