Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sec23aQ01405 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms