Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Top2aQ01320 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms