Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grin2cQ01098 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Grin2cQ01098 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms