Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pax8Q00288 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pax8Q00288 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pax8Q00288 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pax8Q00288 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pax8Q00288 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Pax8Q00288 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms