Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pitx2P97474 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pitx2P97474 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms