Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cmklr1P97468 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cmklr1P97468 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms