Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Pkp1P97350 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pkp1P97350 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms