Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RhodP97348 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RhodP97348 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RhodP97348 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RhodP97348 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RhodP97348 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms