Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SgcdP82347 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SgcdP82347 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SgcdP82347 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms