Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Irx1P81068 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms