Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Otx2P80206 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Otx2P80206 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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