Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CiitaP79621 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CiitaP79621 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms