Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

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Length 970 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc8a1P70414 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc8a1P70414 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms