Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smad1P70340 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smad1P70340 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms