Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vamp7P70280 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Vamp7P70280 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms