Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Rpl23P62830 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms