Protein–RNA interactions for Protein: P62702

Rps4x, 40S ribosomal protein S4, X isoform, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps4xP62702 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rps4xP62702 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms