Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Snrpd1P62315 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Snrpd1P62315 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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