Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
Rps29P62274 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rps29P62274 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms