Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vbp1P61759 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms