Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pcbp1P60335 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms