Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Csrnp3P59055 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms