Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdrg1P59048 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdrg1P59048 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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