Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
P58686 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
P58686 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
P58686 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
P58686 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms