Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dpf3P58269 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms