Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Samsn1P57725 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Samsn1P57725 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms