Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp25P57080 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms