Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gp1bbP56400 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gp1bbP56400 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms