Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh3bp1P55194 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3bp1P55194 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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