Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rad23aP54726 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms