Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Epb41l4aP52963 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms