Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ClgnP52194 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ClgnP52194 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms