Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pa2g4P50580 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pa2g4P50580 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms