Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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SftpbP50405 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpbP50405 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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SftpbP50405 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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