Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hcls1P49710 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Hcls1P49710 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hcls1P49710 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Hcls1P49710 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hcls1P49710 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms