Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CitP49025 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CitP49025 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CitP49025 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CitP49025 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CitP49025 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms